Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift172Q6VH22 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift172Q6VH22 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms