Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms