Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms