Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd1Q6PIP5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms