Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms