Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms