Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Herc4Q6PAV2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms