Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp49Q6P9L4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms