Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms