Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Soga3Q6NZL0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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Soga3Q6NZL0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms