Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd2Q6NXI6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms