Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms