Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd11Q6NS46 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms