Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca2Q6DIC0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms