Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q6DFW0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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