Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms