Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170Q6A065 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep170Q6A065 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms