Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Pdzrn3Q69ZS0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Pdzrn3Q69ZS0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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