Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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Sbno1Q689Z5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Sbno1Q689Z5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Sbno1Q689Z5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Sbno1Q689Z5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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Sbno1Q689Z5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Sbno1Q689Z5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno1Q689Z5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms