Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6eQ64253 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6eQ64253 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms