Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20865Q62460 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms