Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TrhQ62361 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TrhQ62361 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrhQ62361 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms