Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Taf6Q62311 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Taf6Q62311 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Taf6Q62311 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Taf6Q62311 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Taf6Q62311 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Taf6Q62311 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Taf6Q62311 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms