Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SypQ62277 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SypQ62277 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SypQ62277 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SypQ62277 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SypQ62277 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms