Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sall3Q62255 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms