Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npm1Q61937 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm1Q61937 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Npm1Q61937 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm1Q61937 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm1Q61937 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm1Q61937 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm1Q61937 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm1Q61937 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms