Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd47Q61735 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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