Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itm2aQ61500 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms