Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf3Q60980 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms