Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc6a4Q60857 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a4Q60857 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms