Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atf3Q60765 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms