Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms