Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gprasp1Q5U4C1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gprasp1Q5U4C1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms