Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms