Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim38Q5SZ99 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim38Q5SZ99 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms