Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brip1Q5SXJ3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms