Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tsr1Q5SWD9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms