Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlha9Q5RJB0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms