Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Trappc1Q5NCF2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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