Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8M2

Odf3b, Outer dense fiber protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3bQ5M8M2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Odf3bQ5M8M2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms