Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms