Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf608Q56A10 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms