Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prune2Q52KR3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms