Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otol1Q4ZJM7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms