Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxn3Q499D0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms