Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms