Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330034G19RikQ3UWX6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms