Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clpsl2Q3UW21 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms