Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms