Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fchsd2Q3USJ8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms